Minha opinião:
Jean no começo do filme fala sobre algo terrível que está por vir. Ciclope comenta algo sobre seus poderes e como, mesmo dormindo, ela tem perdido o controle deles.
Já pensaram que na verdade ela estaria temendo o que se tornaria ? Ou seja, perder o controle sobre os poderes e matar aqueles que ama sem querer? Será também que algum aspecto negativo desse poder (uma possível Fênix Negra) já não estaria se revelando e a fazendo ter pensamentos ruins? Daí, ela fazer a
escolha que o Xavier comenta depois, ela escolheu se sacrificar por temer aquilo que poderia se tornar. Para proteger os demais. Por isso controlou Noturno para que este não fosse atrás dela. Ela poderia ter feito aquilo da Nave? Poderia. Mas seu objetivo era outro... Eu poderia especular sobre ele, mas não neste tópico.